Après le retour de Magneto, le nouveau ministre de l'intérieur voulu instaurer une nouvelle loi : l'immatriculation des mutants. Cette loi fut approuvée à l'unanimité, malgré son rejet lors du projet du sénateur Kelly. Cette nouvelle loi consistait à s'identifier en tant que mutant pour continuer à vivre normalement, sans poursuite, ni tout ce qui pouvait briser la vie d'autrui.
Bien sûr, tous les mutants n'accepteraient pas de se faire recenser, pensant qu'il y aurait d'autres problèmes qui suivront cette nouvelle loi. Plusieurs mutants ont dû attraper l'antidote plus d'une fois, c'est pourquoi cette loi fut trouvée comme une bonne idée, qui déclencha une guerre civile entre humains et mutants.
L'institut Xavier resta à l'écart de tout ça, sauf lorsqu'il fallait régler certaines bagarres dans des villes importantes des Etats-Unis, notamment à San Fransisco, là où Jean Grey fut tuée... Et miraculeuseument, elle réapparue, après l'effondrement d'une autoroute à deux étages.
Elle revint à l'institut, et redevint X-woman, mais elle ne fut pas vue comme avant. Tornade reçut un coup de téléphone de Moira McTaggert, qui lui avoua que le professeur Xavier était vivant, mais il s'était déplacé dans un autre corps. Les X-men se rendirent sur place et découvrirent le professeur Xavier, de nouveau vivant, dans un corps plus jeune. Il leur dit que c'est grâce à sa télépathie qu'il réussit à revenir d'entre les morts. Mais il l'avait égarée, et par conséquent, il n'était plus qu'un humain désormais.
Les X-men devaient à présent empêcher la nouvelle Confrérie de faire des dégâts ainsi que de faire voter une contre-loi pour empêcher toute guerre...